Water SARS-CoV-2 RT-PCR Test

     

Des études de santé publique démontrent que le test des eaux usées pour détecter le SARS-CoV-2 s’avère être un outil épidémiologique crucial pendant la pandémie de COVID-19.1,2

Le Water SARS-CoV-2 RT-PCR Test est une amplification en chaîne par la polymérase en temps réel après transcription inverse (RT-qPCR) qui détecte et quantifie l’ARN du virus SARS-CoV-2 dans les eaux usées non traitées. Grâce à un leader du secteur fort de plus de 20 ans d’expérience dans la fabrication de kits de test pour l’eau, les services de santé publique, les chercheurs et les laboratoires peuvent fournir en toute confiance des résultats d’une qualité constante afin d’assurer la sécurité de leurs communautés.3

En savoir plus

Aperçu

Validation

  • Protocole validé par le leader de fabrication des tests des eaux usées, notamment la méthode Colilert/Quanty-tray.
  • Flexibilité d’un protocole intégré pour une matrice hautement évolutive
  • Validation sur les instruments RT-qPCR courants3

Qualité constante

  • Test RT-qPCR très sensible permettant la détection des deux régions N1 et N2 du virus3
  • Protocoles complets de contrôle de la qualité permettant d’assurer des résultats d’une qualité constante

Disponibilité

  • La réputation d’excellence d’une chaîne d’approvisionnement : les solutions d’analyse de l’eau d’IDEXX ont un taux de disponibilité supérieur à 99,9 % pour les produits clés3
  • Des sites de production qui garantissent un environnement stérile pour une qualité constante et qui répondent aux normes ISO et BPF
  • Une équipe chargée de l’assistance technique forte de plusieurs dizaines d’années d’expérience dans le domaine des eaux usées

Mode d’emploi

 

Concentration

 

Extraction de l’ARN

 

PCR en temps réel

Étape 1. Pasteuriser l’échantillon à 60°C pendant 1heure et demie. Cette étape est facultative.

Étape 2. Concentrer l’échantillon en utilisant une précipitation au PEG ou équivalent

Étape 3. Extraire l’ARN en utilisant le kit de billes magnétiques ADN/ARN pour l’eau.

Étape 4. Amplifier les acides nucléiques purifiés en utilisant le Water SARS-CoV-2 RT-PCR Test.

En savoir plus sur le Water SARS-CoV-2 RT-PCR Test

 

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Foire aux questions

Les eaux usées brutes n’ayant subi aucun traitement chimique.

Le Water SARS-CoV-2 RT-PCR Test est une amplification en chaîne par la polymérase en temps réel après transcription inverse (RT-qPCR) qui détecte et quantifie l’ARN viral dans un échantillon concentré d’eaux usées préparé de manière appropriée.

Lorsqu’il est utilisé avec le protocole de concentration de 105 mL, la plus faible concentration de SARS-CoV-2 dans les eaux usées détectable par le Water SARS-CoV-2 RT-PCR Test est de l’ordre de1 copie de gène/1 mL.

Le protocole validé par IDEXX concentre le virus SARS-CoV-2 dans 105 mL d’eaux usées. Le personnel de laboratoire peut analyser des volumes d’eau plus ou moins importants en suivant la procédure de base tout en l’adaptant aux différents volumes avec une centrifugeuse appropriée.

Le Water SARS-CoV-2 RT-PCR Test analyse 5 µL d’ARN extrait préparé à partir d’un échantillon concentré d’eaux usées : toutefois nous vous recommandons d’avoir un volume supplémentaire à disposition pour compenser la perte de volume liée au pipetage et pour assurer un double de l’échantillon.

Le protocole validé par IDEXX concentre l’échantillon d’eaux usées en utilisant à la fois la centrifugation et une précipitation au polyéthylène glycol (PEG) et peut être modifié pour répondre aux besoins spécifiques de votre laboratoire. D’autres méthodes de concentration peuvent être également utilisées telles que l’ultrafiltration, les rampes de filtration, etc. Ces méthodes doivent être validées pour en vérifier la performance.

Maintenir un échantillon à basse température permet d’en éviter la dégradation et d’assurer une précipitation efficace du virus SARS-CoV-2.

Le Water SARS-CoV-2 RT-PCR Test a été validé pour une utilisation avec le kit de billes magnétiques ADN/ARN pour l’eau afin d’effectuer l’extraction des acides nucléiques, notamment l’ARN du SARS-CoV-2, à partir d’un concentré d’eaux usées. Le kit de billes magnétiques peut être utilisé manuellement ou avec un processeur magnétique automatique. Voir la notice du produit pour plus d’informations.

Pour chaque série d’échantillons d’eaux usées testés avec le Water SARS-CoV-2 RT-PCR Test, un contrôle positif et négatif de la PCR, ainsi qu’un contrôle positif et négatif d’extraction doivent être analysés en même temps. Une méthode de contrôle doit être également utilisée pour vérifier les résultats attendus.

Veuillez vous référer aux fiches des produits indiquant les conditions de stockage recommandées lors de la réception du produit et après la reconstitution/première utilisation.

Les Centres pour le contrôle et la prévention des maladies aux États-Unis (U.S. CDC) indiquent que le niveau de biosécurité 2 (BSL-2) doit être respecté et que des précautions supplémentaires doivent être prises pour l’analyse d’échantillons prélevés dans l’environnement, y compris pour la manipulation et le traitement des échantillons d’eaux usées liés au SARS-CoV-2. Des directives spécifiques sont disponibles auprès de l’U.S. CDC : Interim Laboratory Biosafety Guidelines for Handling and Processing Specimens Associated with Coronavirus Disease 2019 (COVID-19).4

Veuillez consulter vos autorités sanitaires locales pour connaître les réglementations spécifiques applicables.

Veuillez respecter les procédures recommandées par les autorités sanitaires locales réglementant la manipulation et le traitement d’échantillons d’eaux usées liés au SARS-CoV-2. Voici une source d’information publiée par l’U.S. CDC : Interim Laboratory Biosafety Guidelines for Handling and Processing Specimens Associated with Coronavirus Disease 2019 (COVID-19).4

Veuillez respecter les directives de sécurité et les réglementations locales applicables. 

Si souhaité, un procédé facultatif de traitement thermique peut être utilisé pour inactiver les échantillons grâce à la pasteurisation. Veuillez vous référer à l’exemple fourni dans la fiche du produit. 

L’étape de pasteurisation peut réduire la détection de l’ARN du SARS-CoV-2. Veuillez contacter un représentant de compte IDEXX pour obtenir plus d’informations.

Les échantillons et le matériel doivent être éliminés selon vos normes et réglementations locales.

Le Water SARS-CoV-2 RT-PCR Test n’est pas approuvé par l’agence américaine de protection de l’environnement (U.S. EPA) pour le test du SARS-CoV-2 dans les eaux usées. À l’heure actuelle, l’U.S. EPA ne réglemente pas le test du SARS-CoV-2 pour les eaux usées ni n’approuve de méthodes de test à cet effet. Le test du SARS-CoV-2 pour les eaux usées peut (ou non) être régulé par vos autorités locales et/ou nationales. Veuillez vérifier si une réglementation s’applique dans votre région.

En savoir plus sur le test Eau RT-PCR SARS-CoV-2

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Références

  1. Wurtzer S, Marechal V, Mouchel J-M, et al. Evaluation of lockdown impact on SARS-CoV-2 dynamics through viral genome quantification in Paris wastewaters [preprint posted May 6, 2020]. medRxiv. doi:10.1101/2020.04.12.20062679
  2. Medema G, Heijnen L, Elsinga G, Italiaander R, Brouwer A. Presence of SARS-Coronavirus-2 in sewage [preprint posted March 30, 2020]. medRxiv. doi:10.1101/2020.03.29.20045880
  3. Data on file at IDEXX Laboratories, Inc. Westbrook, Maine USA.
  4. Centers for Disease Control and Prevention. Interim laboratory biosafety guidelines for handling and processing specimens associated with Coronavirus Disease 2019 (COVID-19). www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/lab/lab-biosafety-guidelines.html. Revised June 3, 2020. Accessed July 7, 2020.