Mise à jour sur le coronavirus

Nouvelles souches de coronavirus et patients vétérinaires

Mise à jour des diagnostique • Avril 2020

Un nouveau coronavirus à l’origine d’une éclosion de maladie respiratoire chez l’humain a suscité des questions sur l’importance de ce virus récemment découvert, le cas échéant, pour nos patients vétérinaires. Le présent guide fournit des renseignements sommaires destinés à répondre à certaines des questions les plus fréquemment posées sur le coronavirus. Les connaissances que nous avons des coronavirus et de leur transmission évoluent rapidement, et pour obtenir les renseignements les plus récents, nous vous suggérons de consulter les sources de référence fournies à la fin de la présente mise à jour.

La maladie à coronavirus 2019 (COVID-19) a été détectée pour la première fois en Chine, avec une éclosion initiale dans la ville de Wuhan. La maladie est causée par un nouveau coronavirus appelé SARS-CoV-2 et nous pensons qu’elle a été transmise, à l’origine, par des chauves-souris. Depuis son apparition fin 2019, la COVID-19 s’est propagée dans le monde entier.^1–3

Le virus SARS-CoV-2, à l’origine de la COVID-19, est un coronavirus unique qui infecte les voies respiratoires humaines et est différent des coronavirus précédemment identifiés infectant les êtres humains ou les patients vétérinaires. Les coronavirus constituent une grande famille de virus composée de multiples sous-groupes de virus que l’on trouve couramment chez l’homme ainsi que chez d’autres mammifères, oiseaux et reptiles.

Les coronavirus alpha et bêta (y compris les coronavirus tels que ceux responsables du rhume banal chez l’homme) infectent généralement les mammifères, tandis que les coronavirus gamma et delta infectent généralement les oiseaux et les poissons. La plupart des coronavirus courants responsables de maladies animales, tels que le coronavirus entérique félin, sont des coronavirus appelés alpha. Le SARS-CoV-2, responsable des récentes éclosions respiratoires de COVID-19 chez l’homme, est un coronavirus bêta.

Transmission de la COVID-19 et animaux de compagnie

Les principales autorités de santé publique s’accordent à dire que la COVID-19 est principalement une maladie humaine qui est transmise directement d’un être humain à un autre par les gouttelettes respiratoires.^1-4 Un second mode de transmission est possible : par contact avec une surface infectée par le virus, et plus particulièrement les surfaces lisses, comme le plastique ou le métal.^5,6 Les surfaces poreuses telles que le tissu ou la fourrure sont considérées comme moins susceptibles de transmettre le virus.

Les études récentes réalisées ont démontré que les chats et les furets sont susceptibles d’être infectés en milieu expérimental et de transmettre le virus aux autres animaux, tandis que l’on a pu identifier une résistance générale à ce dernier chez le chien. Ceci s’explique probablement par les différences de récepteurs à l’ACE 2 entre ces espèces.^7-9 Dans quelques cas isolés, on a pu identifier une zoonose inverse (lorsqu’un humain infecté contamine un animal domestique) chez les chats, les furets et les chiens.^10,11 L’infection chez le chat et le furet est souvent subclinique, mais peut être présente et s’accompagner de signes cliniques respiratoires légers, de fièvre et, dans certains cas, de troubles gastro-intestinaux. Chez ces espèces hôtes non primaires, l’infection semble plus courte dans le temps que chez l’humain. Contrairement aux chiens et aux chats, les visons ont été identifiés comme une espèce susceptible d'être infectée par le SARS-CoV-2 (par exemple, par des humains infectés dans des situations de forte densité de population telles que les élevages de visons), et pourraient potentiellement constituer un réservoir d'infection et de mutation virale.¹² Bien que des infections zoonotiques inverses transitoires aient été sporadiquement rapportées chez des chiens vivant avec des humains infectés par le COVID-19, aucun signe clinique n'a été signalé chez ces chiens.^10-13 On ne pense pas que les animaux domestiques jouent un rôle dans la transmission du COVID-19 à l'homme.^1-4

Les connaissances de la transmission du SARS-CoV-2 et de la maladie du COVID-19 évoluent rapidement. Pour obtenir les informations les plus à jour sur le risque de transmission du SARS-CoV-2 aux animaux, veuillez vous rendre sur le site Web des CDC consacré à la COVID-19.

Développement d’un test IDEXX SARS-CoV-2 (COVID-19) RealPCR

IDEXX Reference Laboratories a développé et validé un test PCR en temps réel pour détecter le SARS-CoV-2 sur la base des séquences génétiques publiées du virus provenant de l’épidémie humaine.¹⁴ Le test IDEXX SARS-CoV-2 (COVID-19) RealPCR cible le même gène de nucléocapside que le test du CDC, mais il a été adapté aux animaux grâce à un alignement unique. Il a été précautionneusement conçu pour éviter toute réactivité croisée avec d’autres coronavirus spécifiquement vétérinaires. Les études de spécificité confirment qu’il n’existe aucun risque de réactivité croisée entre le nouveau test PCR et d’autres coronavirus vétérinaires courants qui affectent les animaux de compagnie. De même, il a été démontré que les tests RealPCR actuellement disponibles pour ces coronavirus vétérinaires ne détectent pas l’acide nucléique viral du SARS-CoV-2. 

Pour la première validation du nouveau test SARS-CoV-2 (COVID-19) RealPCR, qui s’est étendue sur quatre semaines, IDEXX a testé plus de 3500 échantillons provenant de chats, de chiens et de chevaux soumis aux Laboratoires de référence IDEXX pour effectuer des bilans respiratoires RealPCR. Ces échantillons ont donné lieu à des tests parallèles, consistant en trois tests réalisés par des Centres de contrôle et de prévention des maladies (CDC). Un sous-ensemble d’échantillons de matières fécales a également été étudié lors de bilans Diarrhée RealPCR, dans le cadre des études de réactivité croisée. Ces échantillons provenaient des États-Unis et de la Corée du Sud. Le dépistage a ensuite été étendu au Canada et aux pays européens à partir de la mi-mars, incluant ainsi des zones avec un taux élevé de population infectée par la COVID-19.

Instructions concernant le prélèvement d’un échantillon du SARS-CoV-2

Nous vous encourageons à consulter le bureau de votre vétérinaire en chef provincial ou territorial pour connaître les dernières mesures de sécurité pour le prélèvement d’échantillons avant de tester pour le SARS-CoV-2 chez un animal de compagnie. Il est recommandé de porter des équipements de protection individuelle (EPI) lors du prélèvement échantillons sur un animal en cas de suspicion d’infection par le SARS-CoV-2. Ceux-ci incluent des gants, un masque, une blouse et une protection pour les yeux.

L’échantillon idéal doit respecter la présentation clinique et l’objectif du test. 

• Pour les manifestations respiratoires : écouvillon pharyngé profond (avec matériel organique visible, frottez fermement) et écouvillon conjonctival (essuyez l’œil, passez l’écouvillon à l’intérieur de la paupière), dans le même tube. Si le patient coopère, vous pouvez ajouter un échantillon prélevé dans la cavité nasale caudale. Veuillez envoyer les écouvillons secs, avec leur tige en plastique, sans milieu de transport, dans un tube à sérum ou tout autre tube vide et stérile; maintenez les échantillons au froid. 
• Pour les manifestations gastro-intestinales : 3 à 5 g (1 g minimum) de matières fécales fraîches dans un contenant stérile et écouvillon pharyngé profond (avec matériel organique visible, frottez fermement) et écouvillon conjonctival (essuyez l’œil, passez l’écouvillon à l’intérieur de la paupière), dans le même tube. Veuillez envoyer les écouvillons secs, avec leur tige en plastique, sans milieu de transport, dans un tube à sérum ou tout autre tube vide et stérile; maintenez les échantillons au froid.
• Aucun signe clinique distinct (p. ex. en cas d’enquête de la santé publique) : 3 à 5 g (1 g minimum) de matières fécales fraîches dans un contenant stérile et écouvillon pharyngé profond (avec matériel organique visible, frottez fermement), écouvillon conjonctif (essuyez l’œil, passez l’écouvillon à l’intérieur de la paupière) et écouvillon nasal caudal, dans le même tube.

Gestion d'un animal positif au SARS-CoV-2

La COVID-19 est une maladie à déclaration obligatoire dans le monde entier. Si un échantillon est testé positif, l’équipe du département de RealPCR d’IDEXX communiquera les renseignements nécessaires aux autorités de santé publique et vétérinaire (par exemple, le bureau du vétérinaire en chef provincial ou territorial), dans le respect des lois relatives à la confidentialité et autres réglementations en vigueur. Le vétérinaire ayant envoyé l’échantillon est alors tenu de signaler tout détail clinique supplémentaire ainsi que les antécédents du patient. Les tests SARS-CoV-2 (COVID-19) RealPCR positifs doivent ensuite être confirmés par un laboratoire gouvernemental tiers, conformément aux instructions réglementaires.

Un résultat positif au COVID-19 chez un animal vivant dans un ménage infecté peut soit résulter d’une transmission zoonotique inversé d'un propriétaire infecté (ou tout autre humain infecté), à son animal de compagnie soit indiquer une contamination de l’environnement. Il est primordial de s’appuyer sur les antécédents, les signes cliniques et les résultats des tests de diagnostic pour les pathologies vétérinaires courantes afin d’interpréter les résultats. 

L’animal infecté doit être traité de manière symptomatique, selon ses signes cliniques. Il faut également surveiller l’apparition de complications secondaires (p. ex. une infection bactérienne). Si les symptômes respiratoires ne sont pas assez graves pour requérir une hospitalisation, il est recommandé d’isoler l’animal chez lui, avec son propriétaire. S’il n’y a pas d’antécédent d’infection humaine par la COVID-19 dans le ménage, il est recommandé de consulter une autorité de santé publique pour déterminer la procédure de test des humains du ménage et le traitement de l’animal infecté. On peut répéter le test RealPCR après une à deux semaines pour confirmer que l’animal n’est plus positif et considérer le ménage comme non infecté ou permettre à l’animal d’entrer à nouveau en contact avec d’autres animaux jusque-là non exposés (plus particulièrement s’il s’agit de chats ou de furets). 

Prévention d’une infection par la COVID-19

Les recommandations visant à prévenir la propagation de la COVID-19 sont axées sur la prévention de l’exposition. Il s’agit notamment de limiter les contacts de personne à personne avec les individus malades, de limiter les déplacements et la participation à des rassemblements de grands nombres de personnes, de se laver régulièrement les mains et de se couvrir la bouche et le nez lorsque l’on tousse ou que l’on éternue.^1,2

À l’heure actuelle, il n’existe aucun médicament antiviral dont l’efficacité pour le traitement de la COVID-19 a été prouvée. De même, il n’existe actuellement aucun vaccin disponible dans le commerce indiqué pour la prévention de l’infection par le SARS-CoV-2 chez l’homme ou l’animal.

Bien que l’infection zoonotique inversée (transmission de l’humain à son animal de compagnie) soit considérée comme peu courante, si un propriétaire d’animal a été diagnostiqué positif à la COVID-19, l’AVMA, les CDC et les différentes autorités mondiales recommandent de limiter les contacts avec les animaux, dans le but de protéger la santé de ces derniers. Si possible, il est préférable de laisser une autre personne, même au sein du ménage, s’occuper d’eux.